在变化的气候中检测传染病的威胁

气候变化影响着我们的健康和景观。气温上升会威胁到我们呼吸的空气质量，以及我们的食物和水供应。飓风等极端天气事件的发生率增加，可通过污染饮用水(通过接触土壤、污水和受感染的动物)，促进病原体和传播媒介的生长，提高水传播疾病的威胁，以及增加皮肤接触受污染水源的可能性。

钩端螺旋体病是一种由leptospira.这些细菌可以引起肾脏损伤、脑膜炎、肝衰竭、呼吸困难，甚至死亡。它通过接触携带这些细菌的动物的尿液或被受感染动物的尿液污染的环境样本而感染人类。虽然钩端螺旋体病分布在世界各地，但它特别影响热带和亚热带气候的国家(Taniguchi和Póvoa 2019)。在气候灾难期间，它很容易传播，极端天气是一个高风险因素，2017年飓风玛丽亚(Maria)之后，波多黎各爆发了钩端螺旋体病。

追踪罪魁祸首

面对当前的全球气候变化，日本冲绳研究小组（Sato等。2019年）试图开发新工具以系统检测leptospira.为了防止人类感染。该组研究了允许发展的细菌生态系统leptospira.在生物膜形成过程中，研究了哪些动物是将这些病原体传递给人类的潜在储层。

研究人员从日本一个已知的流行地区的环境水样中筛选rRNA特异性靶标leptospira.以及附近的动物。他们采用多重PCR分析高雅前taq.HS DNA聚合酶使用16S rRNA靶标检测细菌，它们由NGS分析（在Illumina MiseQ®平台上）。使用类似的程序PrimeSTAR HS DNA聚合酶从相同的环境样品中检测来自脊椎动物的12S rRNA，以了解哪种脊椎动物更容易港口leptospira.(图1)某些动物的存在，特别是公猪和鳗鱼，似乎与高水平的leptospira.，显示了病原体和携带者之间的潜在联系。他们能够绘制出有助于传播致病性的主要细菌(12种菌株)之间的相关性leptospira.和那些是这些细菌的主要储层的动物（10种）。该研究中使用的多路复用PCR方法是一个有助于确定如何的工具leptospira.通过展示环境如何影响这种病原体的发展，并揭示它是如何与主机/载体互动的影响，可以发生爆发。除了提供更好地理解这种现象之外，这些发现有助于开发一个系统以更好地预测人类感染风险。

图1.基于两步尾PCR的遗传测序的库制备程序的示意图。在第一步中应用多重PCRleptospira.和细菌检测。脊椎动物线粒体12S rRNA测序程序与Miya et al. 2015基本相同，但略有修改。图片和标题改编自Sato等。2019年在a下使用Creative Commons attage 4.0国际许可证。

为什么我们的聚合酶是所选的调查工具

这项研究强调了Takara的使用前taq.HS和PrimeSTAR HS DNA聚合酶用于检测环境水样中的细菌，由于存在聚合酶链反应抑制污染物，通常很难处理。它证明了这两种酶对具有挑战性的样品进行DNA扩增的稳健性。由于筛选分析可以帮助预防气候危机引发的健康灾难，由于气候变化，气候危机发生的频率和严重性都更高，因此拥有可靠的试剂为这些分析提供动力，对于提前应对未来的疫情至关重要。

参考文献

波多黎各发现的致命细菌疾病高患病率。耶鲁医学院。https://medicine.yale.edu/news-article/20887/

钩端螺旋体病|疾控中心。https://www.cdc.gov/leptospirosis/index.html.

Miya，M.等等。MIFISH，一组通用PCR引物用于从鱼类中逐出环境DNA：检测超过230个亚热带海洋物种。R. SoC。打开SCI。2，（2015）。

佐藤,Y。等等。环境DNA地区分析病原体leptospira.以及日本钩端螺旋体病流行地区的相关生物。SCI。代表。9，1 - 11(2019)。

Taniguchi，L. U.＆Póvoa，P.Leptospirosis：其中一种被遗忘的疾病。重症监护医学。45岁的1,816-1,818（2019）。