癌症生物标志物的基因表达定量
诊断癌症和疾病的主要方法依赖于冗长、昂贵和复杂的组织学技术，这些技术通常用于已经出现症状的患者，从而进一步处于疾病状态。理想情况下，诊断方法应该是快速有效的，能够在症状前和症状性人群中进行负担得起的精确筛查。来自循环液或FFPE组织的核酸已成为研究癌症和疾病的一类潜在生物标记物。临床上，核酸已经被用于产前诊断检测，许多候选检测正在出现，用于各种疾病状态。这些生物标记物通常分为四大类：DNA、mRNA、microRNA（miRNA）和长非编码RNA（lncRNA）。
已经报道了许多类型癌症的mRNA标记，包括肝脏，乳房和前列腺。然而，mRNA的高度变异性和周转变化使其成为精确诊断的具有挑战性的候选者。miRNA是一种小（典型约为20nt）的非编码RNA，通常认为调节基因表达。与编码MRNA不同，MIRNA往往是相对稳定和抗碎裂的。目前，已经确定了数千种独特的MIRNA，具有数百种疾病的影响，包括许多类型的癌症。LNCRNA较长（通常> 200nt）转录物，其不用于特定蛋白质。类似于miRNA，通常认为LNCRNA参与基因调节。已经以多种形式的癌症鉴定了数十万的LNCRNA。
PCR、qPCR和RT-qPCR是一种分子技术，用于检测和定量多种样本来源中的基因和基因表达。这些技术允许快速、灵敏和准确地检测潜在的癌症生物标志物。
重点产品
全基因组SNP阵列钛DNA扩增试剂盒
细胞遗传学微阵列为检测特定基因的突变提供了一种快速、经济的方法，包括低嵌合性、杂合性缺失和拷贝数变化(Eldai et al. 2013)。这些突变已知会影响各种癌症的预后和治疗，如黑色素瘤、结直肠癌和急性淋巴细胞白血病。我们的钛DNA扩增试剂盒已被用于微阵列测定以筛选和发现各种癌症中的突变，例如筛选吹牛与英菲尼迪BRAF测定的固体瘤中的突变（Weyant等，2014）和揭示IKFZ1儿童急性淋巴细胞白血病的缺失（Lopes等人，2016年）。最后，钛酶提供的高产量和一致的质量使Affymetrix基因芯片映射500K分析的用户能够达到SNP基因分型的最高标准（图1）。
图1所示。GeneChip映射500K测定的概述。
RT-qPCR和qPCR试剂盒定量检测基因表达
RT-qPCR和qPCR可以对来自各种来源的RNA和gDNA样本的基因进行敏感的定量，包括循环肿瘤细胞(Lianidou 2016)。我们已经开发了一步RT-qPCR包,两步RT-qPCR包,基于探针的qPCR混合,TB绿为主的qPCR混合在各种人性化的格式，快速，准确，灵敏的检测对癌症的研究兴趣基因。此外，作为癌症研究的原料可能是珍贵的（例如，FFPE组织），我们开发了Takara PreAmp Master Mix在同类中最好的，无偏的预扩增少至12.5 pg的DNA。
这些工具已被用于检测冷冻和FFPE子宫平滑肌肉瘤样本中TrkB信号的变化(Makino et al. 2012)，识别55种不同乳腺癌FFPE组织中的关键miRNAs (Chen et al. 2016)MAF1.在一次人肝细胞癌肿瘤中（Li等人。2016），量化下调莎丽肿瘤抑制剂在前列腺癌组织和细胞中，准确且专门检测改变的表达RSK4(Jiang et al. 2017)，并确保162个乳腺癌相关基因在FFPE组织样本中可重复表达(查看技术说明）.
我们还开发了冻干预验证底漆组用于结直肠癌、胰腺癌、前列腺癌、黑色素瘤、小细胞肺癌和非小细胞肺癌。
敏感的miRNA量化w它h Mir-X miRNA qRT-PCR TB Green试剂盒
能够准确和敏感地量化罕见miRNA对于理解和跟踪各种类型癌症的信号网络至关重要(Hayes等，2014)。我们的米尔-X的miRNA定量RT-PCR TB绿色套装使用一个单步、单管反应产生第一链cDNA,然后专门和定量放大使用miRNA-specific底漆和结核病绿色优势qPCR化学(图2)。这使得简单和准确的microrna的大量样本中检测到50份类型包括等离子体(Kanemaru et al . 2011年),外泌体(Lee et al. 2013)和FFPE组织(Lee et al. 2013)。
图2。Mir-X miRNA qRT-PCR TB Green试剂盒工作流程。
利用SmartChip Real-Time PCR系统进行高通量基因表达分析
筛选这些生物标志物的挑战之一是需要筛选各种样本类型中的数百个潜在靶标。高通量qPCR已经成为一种潜在的解决方案，能够快速和敏感地检测许多靶标。的智能芯片实时PCR系统已在概况miRNA（Choo等人2014），Lncrna（Leucci等，2016）的许多出版物中使用，以及来自包括血液的多种样品类型的不同形式的癌症和疾病的mRNA（Chen等，2016），细胞系，T细胞，血浆和各种类型的患者活组织检查。对于所有这些研究至关重要是Smartchip系统支持许多测定和样品配置的能力，因为每种疾病都有独特而变化的生物标志物。通过协作，我们帮助研究人员设计并利用多面板用于mRNA，miRNA和LNCRNA，其能够为其在Smartchip系统中疾病的疾病模型中对关键生物标志物进行高通量筛选。要了解有关这些面板和研究的更多信息，请访问SmartChip系统应用程序页面．
参考和产品相关文献索引
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