癌症生物标志物的基因表达量化
诊断癌症和疾病的主要方法依赖于冗长、昂贵和复杂的组织学技术，这些技术通常用于已经有症状的患者，因此病情还在进一步发展。理想情况下，诊断方法应该是快速和有效的，能够负担得起的，在症状前和症状人群中进行精确的筛查。无论是来自循环液还是FFPE组织的核酸，都已成为研究癌症和疾病的潜在生物标志物。在临床上，核酸已经被用于产前诊断测试，许多候选测试正在出现，用于各种疾病状态。这些生物标志物通常分为四大类:DNA、mRNA、microRNA (miRNA)和长链非编码RNA (lncRNA)。
许多类型的癌症，包括肝癌、乳腺癌和前列腺癌的mRNA标记都已被报道过。然而，mRNA的高变异性和周转率使其成为具有挑战性的精确诊断候选者。miRNA是一种小的(通常为20 nt)非编码RNA，通常被认为是调节基因表达的。与编码mrna不同，mirna趋向于相对稳定和抗碎片化。目前，已经发现了数千种独特的mirna，这些mirna涉及数百种疾病，包括多种类型的癌症。lncrna较长(通常为>200 nt)的转录本不编码特定的蛋白质。与miRNA类似，lncRNA通常被认为参与基因调控。成千上万的lncrna已经在多种癌症中被发现。
PCR、qPCR和RT-qPCR是一种分子技术，用于检测和定量多种样本来源中的基因和基因表达。这些技术允许快速、灵敏和准确地检测潜在的癌症生物标志物。
突出产品
全基因组SNP阵列钛DNA扩增试剂盒
细胞遗传学微阵列提供用于检测特定基因，包括低级嵌合，杂合性缺失的突变的快速和成本有效的方法，和拷贝数变化（Eldai等人2013）。这些突变已知影响各种癌症如黑色素瘤，结肠直肠癌，和急性淋巴细胞白血病的预后和治疗。我们的钛DNA扩增试剂盒已经被用于微阵列分析来筛查和发现各种癌症的突变，如筛查BRAF使用INFINITI BRAF Assay (Weyant et al. 2014)发现实体肿瘤的突变IKFZ1儿童急性淋巴细胞白血病的缺失(Lopes et al. 2016)。最后，Titanium酶提供的高产量和稳定的质量使Affymetrix基因芯片Mapping 500K Assay的用户能够实现SNP基因分型的最高标准(图1)。
图1所示。500K基因芯片定位方法概述。
RT-qPCR和qPCR试剂盒定量检测基因表达
RT-qPCR和qPCR可以对来自各种来源的RNA和gDNA样本的基因进行敏感的定量，包括循环肿瘤细胞(Lianidou 2016)。我们已经开发了一步RT-qPCR包，两步RT-qPCR包，probe-based qPCR混合,TB绿色qPCR混合在各种用户友好的格式，快速，准确，和敏感的基因检测感兴趣的癌症研究。此外，由于癌症研究的起始材料可能是宝贵的(如FFPE组织)，我们开发了我们的Takara PreAmp Master Mix在同类中最好的，无偏的预扩增少至12.5 pg的DNA。
这些工具已被用于检测冷冻和FFPE子宫平滑肌肉瘤样本中TrkB信号的变化(Makino et al. 2012)，识别55种不同乳腺癌FFPE组织中的关键miRNAs (Chen et al. 2016)MAF1在原发性人肝癌肿瘤中(Li et al. 2016)，量化的下调莎丽抑癌基因在前列腺癌组织和细胞中的表达，能准确、特异地检测到表达的改变RSK4(Jiang et al. 2017)，并确保162个乳腺癌相关基因在FFPE组织样本中可重复表达(视图技术报告）.
我们还开发了冻干，预验证引物集用于结直肠癌、胰腺癌、前列腺癌、黑色素瘤、小细胞肺癌和非小细胞肺癌。
敏感miRNA定量它h Mir-X miRNA qRT-PCR TB Green试剂盒
能够准确和敏感地量化罕见miRNA对于理解和跟踪各种类型癌症的信号网络至关重要(Hayes等，2014)。我们的Mir-X miRNA qRT-PCR TB Green试剂盒使用一个单步、单管反应产生第一链cDNA,然后专门和定量放大使用miRNA-specific底漆和结核病绿色优势qPCR化学(图2)。这使得简单和准确的microrna的大量样本中检测到50份类型包括等离子体(Kanemaru et al . 2011年),外泌体(Lee et al. 2013)和FFPE组织(Lee et al. 2013)。
图2。Mir-X miRNA qRT-PCR TB Green试剂盒工作流程。
利用SmartChip Real-Time PCR系统进行高通量基因表达分析
筛选这些生物标志物的挑战之一是需要筛选各种样本类型中的数百个潜在靶标。高通量qPCR已经成为一种潜在的解决方案，能够快速和敏感地检测许多靶标。的SmartChip Real-Time PCR系统已在许多出版物中被用于分析来自多种样本类型(包括血液、细胞系、T细胞、血浆和各种类型的患者活检)的不同形式癌症和疾病中的miRNA (Choo et al. 2014)、lncRNA (Leucci et al. 2016)和mRNA (Chen et al. 2016)。所有这些研究的关键是SmartChip系统支持大量分析和样本配置的能力，因为每种疾病都有一套独特的、不断变化的生物标志物。通过合作，我们帮助研究人员设计和利用mRNA、miRNA和lncRNA的多个面板，可以在智能芯片系统上实现对他们感兴趣的疾病模型中的关键生物标志物的高通量筛选。要了解更多关于这些小组和研究的信息，请访问SmartChip系统应用页面．
参考文献和产品引用
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