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HLA在癌症中的分型

人类白细胞抗原(HLA)是由多个参与免疫调节的基因组成的高度多态区域。HLA分型是这组基因的特征,是一个有价值的工具,针对复发突变和热点涉及癌症发病机制。这种方法也用于在实体器官或同种异体干细胞移植前匹配供体和患者,常用于治疗白血病、淋巴瘤、多发性骨髓瘤和神经母细胞瘤等癌症。下一代测序(NGS)是用于进行HLA分型的最新技术,与LD PCR等传统技术相比,其精确度更高,成本更低(Hosomichi et al. 2015)。在HLA分型背景下,NGS需要特异性、保真度和健壮性,以与广泛的复杂DNA模板一起工作。我们提供高质量和高性能的HLA分型工具,包括靶向测序的高保真聚合酶和NGS库制备试剂盒。

突出产品

我们的PrimeSTAR GXL和豆类LA TaqDNA聚合酶已被证明是通过靶向测序(NGS和Sanger)进行HLA分型的理想酶,因为它们具有高保真度、强大的长片段扩增能力和gc -富模板的耐候性。事实上,一些出版物已经引用了PrimeSTAR GXL和/或LA Taq用于HLA分型的酶(Liu et al. 2018;Xu, Wang, and Hong 2017;Yin et al. 2016;Mayor等人201;Lan et al. 2015;尾崎等人2013;Ozaki et al. 2015), Anthony Nolan和NHSBT(伦敦,英国)都经常使用这些酶进行HLA分型。

另外,我们的聪明PicoPLEX编剧协会和智能PicoPLEX金单细胞dna测序试剂盒允许强大的全基因组扩增(下游应用:通过NGS、Sanger或array进行HLA分型),甚至从单细胞(Murphy et al. 2016;Png等,2011)。更智能的PicoPLEX黄金技术(图1)以一种流线型和直接的工作流程,允许从单细胞中进行健壮和可复制的全基因组扩增。更智能的ThruPLEX DNA-Seq试剂盒也可用于NGS库的准备。

聪明PicoPLEX工作流 更智能的PicoPLEX黄金工作流

图1所示。智能PicoPLEX金单细胞DNA-Seq技术。面板。原理图描述了简单的四步PicoPLEX黄金工作流程,具有最少的动手时间。面板B。图示PicoPLEX金的化学性质。以步骤1提取的细胞gDNA为模板,进行准随机引物、线性扩增、指数库扩增等多次循环。


参考文献和产品引用

Hosomichi, K。et al。下一代测序技术对HLA研究的影响。j .的嗡嗡声。麝猫。60岁,665 - 673(2015)。

局域网,j . H。et al。Illumina三种文库构建方法对GC偏倚和HLA基因型调用的影响嗡嗡声。Immunol。76年,166 - 175(2015)。

刘,C。et al。牛津纳米孔测序人类白细胞抗原I类基因的精确分型。j·摩尔,成岩作用。2,006(2018)。

市长:P。et al。下一代的HLA分型。《公共科学图书馆•综合》10日,e0127153(2015)。

墨菲:M。et al。从单染色体对人白细胞抗原系统进行单倍型分析。科学。代表。6,30381(2016)。

Png, E。et al。印度尼西亚人群中乙肝疫苗应答的全基因组关联研究揭示了HLA区域中多种独立的危险变异。嗡嗡声。摩尔,麝猫。20.3893 - 3898(2011)。

Ozaki Y。et al。采用长程PCR和高通量测序技术进行HLA-DRB1、-DRB3、-DRB4和-DRB5基因分型。组织抗原83年,10到16(2013)。

Ozaki Y。et al。利用下一代测序技术,在一次多样本分析运行中对多达9个经典HLA位点进行常规基因分型。BMC基因组学16日,318(2015)。

徐,Y.-P。、王S.-X。&香港,W.-X。一个新的HLA-E等位基因,HLA-E * 01:01:01:06在一名中国白血病患者身上发现。HLA89年,260 - 262(2017)。

阴,Y。et al。高通量下一代测序用于颊部提取DNA HLA分型的应用:来自超过10,000个供体招募样本的结果。《公共科学图书馆•综合》11,e0165810(2016)。


主打产品

猫。# 产品 大小 许可证 数量 细节
R300669 PicoPLEX®金单细胞DNA-seq试剂盒 24 Rxns *

PicoPLEX金单细胞DNA- seq试剂盒旨在从单细胞生成高质量的DNA库,用于Illumina平台上的测序。该试剂盒基于创新的PicoPLEX技术,从1-5个哺乳动物细胞或基因组等量的gDNA作为输入,获得了具有较高重现性的文库,可从富尔马林固定的单细胞等具有挑战性的样品中提供可靠的结果。单指标,双指标,和独特的双指标试剂盒是可用的,必须单独购买。该产品含有可用于24种反应的试剂。

该套件具有精简的工作流程,包括从输入到放大NGS库的四个步骤,可以在不到四个小时内完成。该试剂盒使用高保真酶和优化的引物,适用于拷贝数变异(CNVs)、单核苷酸变异(SNVs)、插入和其他小型结构变异的准确和可重复分析。该试剂盒兼容来自人类、动物和细菌的单细胞和纯化的DNA,以及单个流动分选的染色体。

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我们的产品将用于研究只使用.它们不得用于任何其他目的,包括但不限于人类使用、治疗或诊断用途,或任何类型的商业用途。未经我们事先书面批准,不得将我们的产品转让给第三方、转售、修改用于转售,或用于制造商业产品或向第三方提供服务。

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更智能的PicoPLEX金单细胞DNA-Seq技术:从单个细胞开始的四步反应

更智能的PicoPLEX金单细胞DNA-Seq技术:从单个细胞开始的四步反应

更智能的PicoPLEX金单细胞DNA-Seq技术:从单个细胞开始的四步反应。以步骤1提取的细胞gDNA为模板,进行准随机引物、线性扩增、指数库扩增等多次循环。

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SMARTer PicoPLEX金单细胞DNA-Seq试剂盒工作流程

SMARTer PicoPLEX金单细胞DNA-Seq试剂盒工作流程

SMARTer PicoPLEX金单细胞DNA-Seq试剂盒工作流程。四步SMARTer PicoPLEX金单细胞DNA-Seq工作流在两个管或板中进行,并在不到3小时内完成,只需30分钟的动手时间。

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PicoPLEX金单细胞DNA-seq试剂盒

PicoPLEX金单细胞DNA-seq试剂盒
R300671 PicoPLEX®单细胞WGA试剂盒 24 Rxns *

PicoPLEX单细胞WGA试剂盒采用单管设计,用于从1-10个细胞或等量分离的gDNA开始的单拷贝基因组DNA (gDNA)的可重复扩增。接着是细胞裂解和全基因组预扩增,扩增后的文库本底极低,3小时内产物的典型产量为8-12µg。这个系统最适合于高产量最重要的应用。该产品含有可用于24种反应的试剂。

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PicoPLEX单细胞WGA试剂盒

PicoPLEX单细胞WGA试剂盒
RF220Q PrimeSTAR®GXL SP DNA聚合酶 250 U *

PrimeSTAR GXL SP DNA聚合酶是一种热启动的高保真PCR酶。它擅长与Ge c的模板,x转运的模板,long扩增到30kb (GXL)。聚合酶由单独的优化缓冲液(Mg2 ++)和核苷酸。猫。RF220Q是一种注册通用试剂(GPR),适用于一般实验室应用,包括分子诊断开发和测试。

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在富含气相色谱的模板上产品产量的例子:PrimeSTAR GXL DNA聚合酶与其他四种商业可用的高保真DNA聚合酶的比较

在富含气相色谱的模板上产品产量的例子:PrimeSTAR GXL DNA聚合酶与其他四种商业可用的高保真DNA聚合酶的比较
在富含气相色谱的模板上产品产量的例子:PrimeSTAR GXL DNA聚合酶与其他四种商业可用的高保真DNA聚合酶的比较。T公司的酶包括针对富含gc的模板进行优化的缓冲液。

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PrimeSTAR GXL DNA聚合酶可扩增产品高达30 kb(人类基因组DNA模板),40 kb (lambda DNA),或13.5 kb(人类cDNA)

PrimeSTAR GXL DNA聚合酶可扩增产品高达30 kb(人类基因组DNA模板),40 kb (lambda DNA),或13.5 kb(人类cDNA)
PrimeSTAR GXL DNA聚合酶可扩增产品高达30 kb(人类基因组DNA模板),40 kb (lambda DNA),或13.5 kb(人类cDNA)。

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PrimeSTAR GXL DNA聚合酶在与多种模板的反应中表现出高效的扩增,包括高水平的模板,抑制了其他商业上可用的高保真DNA聚合酶的活性

PrimeSTAR GXL DNA聚合酶在与多种模板的反应中表现出高效的扩增,包括高水平的模板,抑制了其他商业上可用的高保真DNA聚合酶的活性
PrimeSTAR GXL DNA聚合酶在与多种模板的反应中表现出高效的扩增,包括高水平的模板,抑制了其他商业上可用的高保真DNA聚合酶的活性。

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PrimeSTAR GXL SP DNA聚合酶

PrimeSTAR GXL SP DNA聚合酶
RR002A TaKaRa LA Taq®DNA聚合酶(Mg2+ free buffer) 125个单位 *

豆类LA Taq是一种混合物Taq聚合酶与校对聚合酶。该混合物对长DNA模板(通常为20 kb和48 kb,取决于模板类型)的高保真扩增进行了优化。这LA Taq聚合酶混合物提供单独的优化缓冲液(Mg2 +免费),MgCl2和核苷酸。

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利用Takara LA Taq DNA聚合酶扩增范围为0.5- 35kb的lambda DNA片段。

利用Takara LA Taq DNA聚合酶扩增范围为0.5- 35kb的lambda DNA片段。

利用Takara扩增0.5- 35kb范围的lambda DNA片段LA TaqDNA聚合酶。的LA Taq酶能产生高产量的产物,即使是很长的片段(28 kb)。

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用Takara LA Taq DNA聚合酶扩增人类基因组DNA

用Takara LA Taq DNA聚合酶扩增人类基因组DNA

用Takara扩增人类基因组DNALA TaqDNA聚合酶。以纯化的人类基因组DNA(50µL反应,500 ng)为模板,用Takara对β -球蛋白位点和TPA基因区域进行PCR扩增LA Taq聚合酶。扩增产物大小分别为17.5 kb(1巷)、21.5 kb(2巷)和27 kb(3巷)。M巷为高分子量标记(Fisher Scientific)。

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RR002A: TaKaRa LA Taq DNA聚合酶(Mg2+ free buffer)

RR002A: TaKaRa LA Taq DNA聚合酶(Mg2+ free buffer)
R400674 ThruPLEX®DNA-Seq工具包 24 Rxns *

ThruPLEX DNA- seq试剂盒建立在创新的ThruPLEX化学基础上,从低至50 pg的DNA生成高度复杂的DNA库。单指标,双指标,和独特的双指标试剂盒是可用的,必须单独购买。该产品含有可用于24种反应的试剂。

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R400674: ThruPLEX DNA-Seq试剂盒

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