用户生成的DNA靶浓缩方案的ThruPLEX套件
值得注意的是，来自PGD胚胎的PicoPLEX DNA-seq文库的测序数据清楚地显示出两个小的、不平衡的片段，这与高分辨率鱼类重新测试最初被评分为正常的母体血液样本的预测模式一致。这是一个重要的例子，揭示了微阵列遗漏的隐性易位的胚胎测序数据。”
-Brian Mariani，博士，首席科学家，遗传学和体外受精研究所科学主任
目标富集是一种样品制备策略，用于分离和测序感兴趣的基因，降低成本和提高信息学效率。例如，在外显子组富集中，感兴趣的基因是人类基因组的整个外显子组，约占人类基因组的1%和约30 Mb的序列。虽然存在优秀的富集工具，但许多可用的库准备产品在低输入样本的情况下难以有效执行。与其他套件相比，ThruPLEX套件能够创建输入DNA水平大大降低的库，同时提供至少相同的数据。
目标富集工作流程
在典型的靶向测序流程中，文库由纯化的DNA构建，通过使用寡核苷酸探针的基于溶液的杂交富集特定目标或基因，然后测序。目前，一些公司提供了用于富集特定靶点的工具，他们开发了靶点富集试剂盒和面板，用于从各种DNA来源（包括血浆、新鲜组织和FFPE样本）制备的文库。这些试剂盒包含设计用于通过杂交捕获相关基因（例如，整个外显子组）的寡核苷酸。从ThruPLEX试剂盒制备的库与这些目标富集试剂盒兼容，并提供优异的性能，特别是在低输入样本的情况下。
库是按照标准的ThruPLEX协议编写的。如果是多路复用，则必须使用唯一索引来创建库。库是池的，并添加了xGen Universal Blockers以抑制雏菊链(将库片段相互绑定)。然后根据制造商的说明，在目标浓缩方案中使用该样品。
净化DNA
剪切DNA(如有需要)
准备ThruPLEX库:修复，添加适配器，放大
使用AMPure XP进行清理
量化和汇总（如有必要）
与阻塞oligos结合
杂交、捕获和清洗
放大
池(如果必要)和清理
量化丰富图书馆
序列
将ThruPLEX套件与目标浓缩系统集成的协议:
Illumina公司Nextera协议
使用Illumina Nextera快速捕获外显子富集试剂盒富集ThruPLEX文库的协议。
罗氏NimbleGen SeqCap EZ协议
罗氏NimbleGen SeqCap EZ系统用于ThruPLEX库目标富集的协议。
xGen锁定探测协议
使用IDT xGen靶浓缩面板对ThruPLEX库进行靶浓缩的协议
安捷伦SureSelectXT协议
使用安捷伦SureSelectXT目标富集系统的ThruPLEX库的目标富集协议。
安捷伦SureSelectXT2协议
使用安捷伦SureSelectXT2目标富集系统对ThruPLEX库进行目标富集的协议。
安捷伦SureSelectQXT协议
使用安捷伦SureSelectQXT目标充实系统对ThruPLEX库进行目标充实的协议。
为ThruPLEX Plasma- seq准备血浆
为ThruPLEX plasma - seq工作流程准备高质量等离子体的协议。
用户生成协议
用户生成的协议基于内部概念验证实验、客户协作和已发表的文献。在某些情况下，相关结果将在我们的研究新闻BioView博客文章. 虽然我们希望这些协议在您手中能够成功，但它们可能没有得到充分审查或优化。我们鼓励您与我们联系或参考已发表的文献，以了解有关这些用户生成和报告的协议的更多信息。
如果您正在寻找特定于产品的、完全优化的用户手册或协议一览，请访问该产品的产品页面，在价格表中打开该产品的产品详细信息行，然后单击文档。有关查找文件的更详细说明，请参阅我们的网站常见问题页面。
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