用户生成的DNA针对螺旋套件的富集协议
值得注意的是，来自PGD胚胎的Picoplex DNA-SEQ文库的测序数据清楚地显示出两个小，不平衡的段，与来自高分辨率鱼类重新测试的预测模式一致，其母体血液样本最初被评定为正常。这是从胚胎暴露被微阵列错过的密码易位的胚胎测序数据的一个重要示例。“
-Brian Mariani博士，遗传学和体外受精研究所首席科学家、科学主任
目标富集是一种样品制备策略，用于分离和测序感兴趣的基因，降低成本和提高信息学效率。例如，在外显子组富集中，感兴趣的基因是人类基因组的整个外显子组，约占人类基因组的1%和约30 Mb的序列。虽然存在优秀的富集工具，但许多可用的库准备产品在低输入样本的情况下难以有效执行。与其他套件相比，ThruPLEX套件能够创建输入DNA水平大大降低的库，同时提供至少相同的数据。
目标富集工作流程
在典型的靶向测序工作流程中，从纯化的DNA构建文库，利用寡核苷酸探针对特定的目标或基因通过基于溶液的杂交富集，然后进行测序。现在有几家公司提供了富集特定目标的工具，他们已经开发了用于从各种DNA来源(包括血浆、新鲜组织和FFPE样品)制备文库的目标富集试剂盒和面板。这些试剂盒包含通过杂交来捕获感兴趣的基因(例如，整个外显子组)的寡核苷酸。从ThruPLEX套件准备的库与这些目标富集套件兼容，并提供卓越的性能，特别是低输入样品。
库是按照标准的ThruPLEX协议编写的。如果是多路复用，则必须使用唯一索引来创建库。库是池的，并添加了xGen Universal Blockers以抑制雏菊链(将库片段相互绑定)。然后根据制造商的说明，在目标浓缩方案中使用该样品。
纯化DNA
剪切DNA（如有必要）
准备ThruPLEX库：修复、添加适配器、放大
使用AMPure XP进行清理
量化和汇集(如有必要)
与封闭寡糖结合
杂交，捕获，清洗
放大
池(如果必要)和清理
量化丰富的图书馆
序列
用于将Thruplex套件与目标浓缩系统集成的协议：
Illumina Nextera协议
使用Illumina Nextera快速捕获外显子组富集试剂盒对ThruPLEX文库进行外显子组富集的协议。
罗氏NimbleGen SeqCap EZ协议
罗氏NimbleGen SeqCap EZ系统用于ThruPLEX库目标富集的协议。
xGen锁定探测协议
使用IDT xGen目标充实面板对ThruPLEX库进行目标充实的协议
安捷伦Sureselectxt协议
使用安捷伦SureSelectXT目标充实系统对ThruPLEX库进行目标充实的协议。
安捷伦SureSelectXT2协议
使用Agilent Sureselect2靶富集系统靶向血液文库的富集素的方案。
安捷伦SureSelectQXT协议
使用安捷伦SureSelectQXT目标富集系统对ThruPLEX库进行目标富集的协议。
为ThruPLEX Plasma- seq准备血浆
用于为Thruplex等离子体-SEQ工作流制备高质量等离子体的方案。
用户协议
用户生成的协议基于内部概念实验，客户合作和出版的文献。在某些情况下，我们的讨论了相关结果研究新闻BioView博客文章．虽然我们希望这些协议能够在您的手中获得成功，但它们可能没有得到充分的审查或优化。我们鼓励您联系我们或参考已发表的文献，以获得关于这些用户生成和报告的协议的更多信息。
如果您要查找特定于产品的、完全优化的用户手册或协议一览表，请访问该产品的产品页面，在价格表中打开该项目的产品详细信息行，然后单击文档。有关查找文档的更详细说明，请访问我们的网站的faq页面。
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